Za učešće u ubistvima najmanje 150 civila bošnjačke nacionalnosti počinjenim u julu 1992. u Zecovima, sa Stojnićem su optuženi Dušan Milunić, Radovan Četić, Duško Zorić, Zoran Stojnić, Ilija Zorić, Željko Grbić, Zoran Milunić, Boško Grujičić, Ljubiša Četić, Rade i Uroš Grujčić te Rajko Gnjatović.

Prema optužnici, oni su bili pripadnici Rasavačke čete 6. bataljona 43. brigade Vojske Republike Srpske (VRS), rezervne milicije i drugih formacija. Prema riječima Brkića, zajedno s Radomirom u ovom predmetu optužen je i njegov sin Zoran, dok je drugi sin Goran bio svjedok u januaru 2020. godine.

Stojnić zvani Grom se teretio kao komandir rezervne stanice milicije Rasavci koja je organizirana u okviru Stanice javne bezbjednosti (SJB) Prijedor, a koja je djelovala kao dio milicije Ministarstva unutrašnjih poslova Republike Srpske (MUP RS).

Prema optužnici, zajedno s Dušanom Milunićem i Radovanom Četićem, nije učinio ništa da spriječi progon civila bošnjačke nacionalnosti s područja sela Zecovi, ubistva, deportacije i prisilno preseljenje stanovništva ili drugo teško oduzimanje slobode.

Kako stoji u optužnici, oni su se 22. jula 1992. sastali u Rasavcima i prenijeli plan da se 23. jula otpočne s akcijom pretresa sela Zecovi iako su znali da u selu više oružja nema. Kako se navodi, Milunić i Radomir Stojnić, uz prisustvo Četića 23. jula, izvršili su postrojavanje Rasavačke čete i saopćili plan kretanja vojske i policije kroz selo.

Stojnić, zajedno s Milunićem i Četićem, teretio se da je naredio pripadnicima vojno-policijskih snaga da uklone tijela 32 ubijene osobe u zaseoku Gradina i na taj način osigurao prikrivanje tragova tog zločina.

Stojnić je druga osoba iz ovog predmeta koja je preminula. U maju 2018. godine Sud BiH obustavio je postupak protiv Zdravka Antonića zbog njegove smrti.

U martu ove godine pred Sudom BiH odgođeno je suđenje u ovom predmetu zbog bolesti optuženog Stojnića, odnosno njegovog nedolaska, dok je 13. maja vještakinja medicinske struke zaključila da on nije sposoban za sudski postupak. Tada je navela da je nemoguće predvidjeti da li će i kada biti u stanju da se pojavi u sudnici. Na tom ročištu dogovarano je i razdvajanje postupka.

Suđenje u ovom predmetu je počelo u aprilu 2015., a od januara 2020. održana su tri glavna pretresa. Suđenja su odgađana zbog pandemije, o čemu je BIRN BiH ranije pisao, a trenutno je postupak u fazi izvođenja dokaza Odbrane. Nastavak suđenja je zakazan za 10. juni.